1966年，文化大革命開始，鑒于國際形勢的變化，以及西北第一套核設(shè)施已經(jīng)建成，中央決定將核工業(yè)轉(zhuǎn)入西南三線地區(qū)。

1965年至1967年，103公司四處、二處、一處先后進(jìn)入四川，承擔(dān)三線第二套核設(shè)施安裝工作。

1966年12月，103公司部分領(lǐng)導(dǎo)及機(jī)關(guān)人員進(jìn)入四川成都，組建二機(jī)部西南二三安裝工程公司。

1967年6月17日，我國成功爆炸第一顆氫彈。

1969年5月，103公司機(jī)關(guān)由404地區(qū)遷入四川廣元821地區(qū)。

1969年10月，西南二三公司機(jī)關(guān)遷入821地區(qū)，歸并到103公司機(jī)關(guān)，統(tǒng)一定名為二機(jī)部二三安裝工程公司。1969年下半年，參加821工程會戰(zhàn)。

1969年底，除紅星機(jī)械廠留蘭州外，二三公司下轄的五個工程處全部進(jìn)入四川三線地區(qū)。

1972年10月，公司在蘭州召開了首屆公司運(yùn)動會。

1974年，五處遷入上海參加上海石化總廠建設(shè)。1982年7月，五處改稱“核工業(yè)部第五安裝工程公司”（現(xiàn)為“中國核工業(yè)第五安裝公司”），劃歸核工業(yè)部建工局直接領(lǐng)導(dǎo)。

1978年1月，公司在廣元召開了首屆公司科技大會，盛況空前。

1979年7月，公司與紡織工業(yè)部達(dá)成協(xié)議，抽調(diào)1200人組建紡織安裝公司（現(xiàn)為“中核華譽(yù)工程有限責(zé)任公司），承擔(dān)儀征化纖廠建設(shè)。

1982年8月，核工業(yè)部決定，公司對外名稱為“國營二三安裝工程公司”，對內(nèi)為“核工業(yè)部二三安裝工程公司”。

從1967年到1982年，我公司在西南地區(qū)建成了第二套濃縮鈾廠、軍用生產(chǎn)堆及其后處理廠、核武器研制基地，第一座核潛艇陸上模式研制基地及一系列核試驗(yàn)、研究設(shè)施。此外，還建成了813工程、405工程，部分建成816工程。

至1982年底，職工人數(shù)達(dá)到9100人。